В настоящее время у университета имеются соглашения с 200 университетами и научными центрами 50 стран. Особенно активным является сотрудничество ЕГУ с ОБСЕ, организацией “Синопсис Армения”, Агентством международного развития США, сотрудничество в рамках программ “NFSAT”, “CRDF”, “TEMPUS”. Ярким примером сотрудничества являются сформированные тесные научно-учебные отношения ЕГУ с Объединенным институтом ядерных исследований (РФ, Дубна), Штатским университетом Аризоны (США), Университетом Мичигана (США), Университетом Ростока (Германия), Университетом Трира (Германия), Университетом Флоренции (Италия), Варшавским университетом (Польша), Московским государственным университетом им. М.В. Ломоносова.

Сегодня ЕГУ широко задействован в международных программах: университет является полноправным членом Международной Ассоциации Университетов, Ассоциации Европейских Университетов, Ассоциации Евразийских Университетов, Ассоциации университетов стран Черноморского бассейна, Российского союза ректоров, Международной Ассоциации руководителей университетов.